python实现批量nii文件转换为png图像

Python  /  管理员 发布于 7年前   341

之前介绍过单个nii文件转换成png图像：

https:///article/165693.htm

这里介绍将多个nii文件（保存在一个文件夹下）转换成png图像。且图像单个文件夹的名称与nii名字相同。

import numpy as npimport os    #遍历文件夹import nibabel as nib #nii格式一般都会用到这个包import imageio   #转换成图像 def nii_to_image(niifile): filenames = os.listdir(filepath) #读取nii文件夹 slice_trans = []  for f in filenames:  #开始读取nii文件  img_path = os.path.join(filepath, f)  img = nib.load(img_path)    #读取nii  img_fdata = img.get_fdata()  fname = f.replace('.nii','')   #去掉nii的后缀名  img_f_path = os.path.join(imgfile, fname)  #创建nii对应的图像的文件夹  if not os.path.exists(img_f_path):   os.mkdir(img_f_path)    #新建文件夹   #开始转换为图像  (x,y,z) = img.shape  for i in range(z):      #z是图像的序列   silce = img_fdata[i, :, :]   #选择哪个方向的切片都可以   imageio.imwrite(os.path.join(img_f_path,'{}.png'.format(i)), silce)#保存图像 if __name__ == '__main__': filepath = 'nii的文件夹' imgfile = 'image的文件夹' nii_to_image(filepath)

代码是我自己写的，用于处理ADNI的nii格式完全有效。

以上就是本文的全部内容，希望对大家的学习有所帮助，也希望大家多多支持。