Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存的方法

Python  /  管理员 发布于 7年前   344

mhd格式的文件里面包含的是raw图像的一些头信息,比如图片大小，拍摄日期等等，那么如何可视化图像呢？

import cv2import SimpleITK as sitkimport matplotlib.pyplot as pltimport numpy as npimage =sitk.ReadImage(path)image = sitk.GetArrayFromImage(image)#image = np.squeeze(image[slice, ...]) # if the image is 3d, the slice is integerplt.imshow(image,cmap='gray')plt.axis('off')plt.show()cv2.imwrite('1.png',image)

这里path是mhd文件的路径，并且在该路径下需要有相应的raw文件

这里展示一下我的mdk文件和保存的png文件

在这里如果cv2和ITK模块没有的话可以用pip安装

pip install opencv-python pip install SimpleITK

以上这篇Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存的方法就是小编分享给大家的全部内容了，希望能给大家一个参考，也希望大家多多支持。